了避免夜长梦多,趁着夜晚所有人都睡了,偷偷将俘虏全部杀了,洪如山觉得这是对自己的藐视,两人决裂。
洪承畴听到了墨离的所作所为以后,倒是十分看得起墨离的杀伐果断,提拔他做游击将军,手下带兵500人,跟着洪承畴四处清剿民兵,打胜了以后,休息两个月,总督杨鹤被抓了,洪承畴被提升为三边总督,墨离开始跟着他大展拳脚,但是打了没还没有一个月,出事了,好事,三个起义军的大头目中最NB的王嘉胤死了,被自己部下杀死的,而逼他部下杀他的人,叫做曹文昭(略微提及即可)。
此时三个大头目中只剩下神一魁,但是神一魁已经挂了,手下就四个掌权的人,红军友,李都师,杜三,杨老柴,敌人有五万,洪承畴还调来了王承恩和贺虎臣等人,打了两场,民兵打不过了,开始逃,墨离也跟着带兵追击,结果和大部队分散了,遇到了敌人头目里杜三和他的部队,既然碰上了,就要咬下敌人一块肉下来,杜三也看不起墨离手下的那人,觉得被五百人这么追杀很丢人,叫手下王田带两千人停下来阻击墨离,结果墨离诈败,设置了一个伏击,打败敌军,斩首不计其数,王田也被活捉。(这场战斗中俘虏徐光,因为叶宇此人比较特别,就带过来见墨离,墨离看过后出了一道题,徐光却轻易答出,被墨离收到帐下,因为他是心学学派的人,而墨离做的很多事情也正好符合心学的理念,渐渐完全忠诚于墨离)
后来到了西濠,展开西濠决战,墨离剩下两百跟着曹文昭攻进敌阵,乱砍乱杀,将民兵阵脚冲烂,官兵发动总攻,民兵队伍损失近万人,首领被抓两个,后来曹文昭有带着自己剩下的部队去收拾剩下的民兵,墨离也跟着,后来在南原伏击曹文昭,但是效果不佳,此时墨离的部队算是比较有经验的了,没有因为中了埋伏就慌乱,最后大败敌军,残余民兵继续逃,墨离因为部队伤兵过多而回去,曹文昭继续追击。
回去途中,遇到一伙官兵抢劫一个地主家,墨离带兵上去交涉,交涉无果,双方大打出手,虽然最后墨离赢了,但是却得罪了对方的头目——洪承畴亲兵副将上官齐,(之后南宫纵横率举族加入墨离,并且给墨离带去了大量的金钱田地),回到洪承畴军队大营,墨离开始休息,并且没事就给洪承畴提提意见,但是由于墨离的意见太过于前卫(至少当时是这样),加上上官齐及其党羽不断找麻烦,洪承畴开始讨厌这个话多的手下。(此期间墨离已经开始培养自己的势力,并且在陕西和山西开办手工工厂,并且用赚来的钱从外地购买粮食低价卖给当地平民,名望大涨)
虽然三个大头目死光了,但是他们的残部依然在继续战斗,但是鉴于陕西甘肃打得太狠,他们跑到了山西,(墨离相当一部分产业在山西,听到这个消息立刻请愿要求带兵清剿,但是洪承畴没有批准)那些残部决定团结起来,号召者叫王自用,集结了三十六支军队,什么高迎祥,张献忠,李自成等后期NB的家伙都来了,山西巡抚是个垃圾,没事排兵布阵,指挥乱七八糟,结果民兵攻克多地,崇祯把他撤了,换曹文昭上场,同时出场的还有左良玉,曹文昭因为知道墨离有本事,就想洪承畴要人,墨离才顺理成章地带人到山西,此时他的部队已经换了一批新兵,加上老兵有七百余人,而且统一装备锁链甲,实力大增。
这一仗左良玉两胜一败,不过那一败有惨,全军覆没,自己也是带了几个人才跑回来。曹文昭则带兵进攻民兵,手下加上墨离的部队也才四千人不到,遇到第一个敌人,上天龙,上天龙有上万人,但是不经打,一打就垮,第二个敌人叫混世王,部队是曹文昭的六倍,一番激战,(基本上一遍倒,看着吓人,但是官兵死伤并不大,接下来几个月,基本上搞定了山西的叛乱,最后碰到一个手下有二十万人的紫金梁,双方斗智斗勇,一个月有,紫金梁少了三分之一的部队,